Microsoft'un sitesinde sunduğu açıklamaya göre Windows Vista kullanıcıları SP1 güncellemesinden sonra bazı programların çalışmaz hale geldiğine ya da fonksiyon kaybı yaşadığına şahit olacak. Sorunlu olan programların listesine bakınca çoğunun güvenlik odaklı yazılımlar olduğu görülüyor. Örneğin Trend Micro Internet Security 2008'in durumu risk altında. Kullanıcıların SP1 güncellemesinden sonra bu sorunlu programlara ait güncellemeleri ya da yeni sürümleri yüklemesi tavsiye ediliyor. Sorunlu olduğu bilinen programların listesi burada.